柳州地区传统发酵酸笋细菌多样性研究Study on Bacterial Diversity of Traditional Fermented Sour Bamboo Shoots in Liuzhou Area
陈正培,曹倩,蒋熠琤,周小玲,吴锦兰,崔娜,巩僖,熊建文
摘要(Abstract):
利用高通量测序技术对柳州地区传统酸笋发酵液中的细菌多样性进行分析,旨在为优良菌株的筛选、酸笋发酵体系的优化奠定基础。文章从柳北区、柳城县和鹿寨县3个地区的农户家取发酵年限为1~10年的酸坛发酵液,提取样品中的细菌总DNA,利用Illumina HiSeq测序平台进行细菌多样性测序分析。结果显示:发酵液中的细菌主要分为9个门、13个纲、23个目、36个科、75个属,其中乳杆菌属的丰度达到90%以上,气斯卡多维亚氏菌属和不动杆菌属的丰度大于1%,志贺氏菌属和葡萄球菌属的丰度均低于0.1%;样品间5个物种有差异;样品中共发现39种功能基因,其中糖类代谢基因的丰度约为15%~18%,氨基酸代谢基因丰度为7%~12%,酯类代谢基因丰度约为3%~5%。通过分析样品中的细菌多样性,发现优势菌为乳杆菌属,主要功能基因与糖代谢相关,为今后筛选功能菌株和优化发酵体系提供了理论依据。
关键词(KeyWords): 酸笋;高通量测序;细菌;多样性
基金项目(Foundation): 广西高校中青年教师科研能力提升项目(2020KY60020,2020KY60021);; 大学生创新创业训练项目(202013639006,201913639069,201913639020);; 广西科技大学鹿山学院科研创新项目(2018LSTD02)
作者(Author): 陈正培,曹倩,蒋熠琤,周小玲,吴锦兰,崔娜,巩僖,熊建文
参考文献(References):
- [1]陈正培,蒋潮,夏娴润,等.柳州酸笋中降亚硝酸盐乳酸菌的筛选及鉴定[J].中国酿造,2020,39(3):26-31.
- [2]周金沙,陈晓艺,谭金萍,等.基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析广西无盐发酵酸笋中细菌多样性[J].中国酿造,2019,38(7):85-90.
- [3]LIN L J,DU F M,ZENG J,et al.Deep insights into fungal diversity in traditional Chinese sour soup by Illumina MiSeq sequencing[J].Food Research International,2020,137:25-31.
- [4]赵慧君,葛东颖,刘倩,等.襄阳大头菜不同发酵状态腌制液中细菌多样性分析[J].中国调味品,2018,43(9):44-48.
- [5]张书泰,周斌,童星,等.酱油酿造过程中微生物多样性分析方法研究进展[J].中国调味品,2019,44(2):193-200.
- [6]白光剑,邹伟,李豪,等.应用高通量测序技术分析成品甜芽菜微生物多样性[J].中国调味品,2019,44(5):67-70.
- [7]崔梦君,张振东,万舒曼,等.农家豆瓣酱细菌多样性及其对品质影响的评价[J].食品与发酵工业,2020,46(5):68-73.
- [8]安飞宇,武俊瑞,刘一鸣,等.土壤环境对传统豆酱制酱过程中细菌群落演替的影响[J].食品科学,2019,40(22):96-102.
- [9]宁明,赵馨馨,董蕴,等.基于Illumina MiSeq测序技术不同地区辣椒酱细菌多样性分析[J].中国调味品,2020,45(2):58-63.
- [10]折米娜,望诗琪,赵慧君,等.酸菜水中细菌多样性研究[J].中国调味品,2019,44(1):26-31.
- [11]CAPORASO J G,KUCZYNSKI J,KNIGHT R,et al.QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data[J].Nature Methods,2010,7(5):335-336.
- [12]EDGAR R C.Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST[J].Bioinformatics,2010,26(19):2460-2461.
- [13]HUSON D H,AUCH A,QI J,et al.MEGAN analysis of metagenomic data[J].Genome Research,2007,17(3):377-386.
- [14]刘怡萱,许国琪,曹鹏熙,等.基于16S rRNA高通量测序的西藏农牧区牦牛酸奶菌群多样性[J].食品科学,2020,41(18):92-97.
- [15]孙慧君,张颖,王洪玉,等.传统发酵锦州小菜中主要微生物多样性分析[J].食品科学,2017,38(2):15-19.