基于PCR-DGGE法分析酱菜中乳酸菌群落结构Analysis of Community Structure of Lactic Acid Bacteria in Pickles Based on PCR-DGGE
燕平梅,昝宏雷,赵文婧,陈燕飞,乔宏萍
摘要(Abstract):
文章以不同含盐量的酱菜为对象,通过聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术研究酱菜中乳酸菌的多样性。使用Quantity One软件进行DGGE凝胶图谱条带分析,得到酱菜样品中乳酸菌群落结构特征。研究结果说明,两种酱菜体系乳酸菌丰富度和多样性指数差异显著(P<0.05),均匀度无显著差异(P>0.05)。通过回收DGGE电泳带,经过克隆后测定碱基序列,与GenBank序列对比鉴定,JB样品即高盐酱菜的PCR-DGGE泳带有3条,经鉴定,与γ-变形杆菌(γ-Proteobacterium)、乳酸杆菌(Lactobacillus)、非培养乳酸杆菌(Uncultured Lactobacillus)相似度分别为95%、97%、96%。JA样品即低盐酱菜的PCR-DGGE泳带有4条,经鉴定,与乳酸杆菌(Lactobacillus)、非培养乳酸杆菌(Uncultured Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus sp.)、γ-变形杆菌(γ-Proteobacterium)相似度分别为97%、95%、97%、92%。研究结果表明食盐浓度影响微生物的群落结构。
关键词(KeyWords): 乳酸菌;PCR;变性梯度凝胶电泳;微生物多样性
基金项目(Foundation): 国家自然基金项目(31171743);; 山西省重点研发项目(201603D221008-1)
作者(Author): 燕平梅,昝宏雷,赵文婧,陈燕飞,乔宏萍
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