蔬菜发酵过程中亚硝酸盐对细菌群落积累量的影响Effect of Nitrite on Bacterial Community Accumulation Amount During Vegetable Fermentation
魏振勇,王严,迟雪梅,孙全敏,迟乃玉,张庆芳
摘要(Abstract):
高通量测序(HTS)技术极大地促进了对发酵食品中微生物群落结构变化的相关研究,但是对相对丰度的分析忽略了不同样本之间细菌群落积累量存在的现实差异。该研究设计自然发酵体系(S)与添加亚硝酸盐发酵体系(Y),利用16S rRNA高通量测序技术对发酵过程中微生物群落结构变化进行研究,同时通过将相对丰度与OD_(600 nm)值结合的方法对发酵过程中微生物群落积累量进行量化,只修正分析相对丰度带来的偏差,进而更好地分析蔬菜发酵过程中菌群结构的动态变化。研究结果表明,相对丰度的降低并不能代表其微生物积累量的减少;当相对丰度值没有明显波动时不能表示其菌微生物的积累量也没有波动;相对丰度上升或下降的比例也不能完全说明该菌的积累量也呈现相同比例的增加或减少。该研究中对相对丰度的量化方法还未见报道,对未来利用相对丰度对细菌群落结构研究的方法具有借鉴意义,同时进一步强调在利用高通量测序对微生物群落结构变化进行分析时,不能仅仅考虑微生物的相对丰度,应该同时考虑微生物的总量。
关键词(KeyWords): 蔬菜发酵;亚硝酸盐;相对丰度量化;群落积累量
基金项目(Foundation): 国家重点研发计划(2018YFC0311100)
作者(Author): 魏振勇,王严,迟雪梅,孙全敏,迟乃玉,张庆芳
参考文献(References):
- [1]LIU D M,WANG P,ZHANG X Y,et al.Characterization of nitrite degradation by Lactobacillus casei subsp.rhamnosus LCR 6013[J].PLoS One,2014,9(4):93308.
- [2]WU R,YU M,LIU X,et al.Changes in flavour and microbial diversity during natural fermentation of suan-cai,a traditional food made in Northeast China[J].International Journal of Food Microbiology,2015,211:23-31.
- [3]李继文,姜爱丽,胡文忠,等.东北酸菜的发酵工艺及使用食品抗氧化剂和防腐剂的必要性[J].食品安全质量检测学报,2018,9(19):5090-5094.
- [4]邱怡筠,都芸,左惠君.亚硝酸盐对肉制品的抗氧化及抑制微生物的作用[J].中国饲料,2020(16):9-12.
- [5]BALINT M,BAHRAM M,EREN A M,et al.Millions of reads,thousands of taxa:microbial community structure and associations analyzed via marker genes[J].FEMS Microbiology Reviews,2016,40(5):686-700.
- [6]郝卓莉.酸菜发酵期间细菌群落结构动态变化分析[J].中国酿造,2020,39(7):56-61.
- [7]LIU Z,LI J,WEI B,et al.Bacterial community and composition in Jiang-shui and Suan-cai revealed by high-throughput sequencing of 16S rRNA[J]International Journal of Food Microbiology,2019,306:108271.
- [8]PENG Q,JIANG S,CHEN J,et al.Unique microbial diversity and metabolic pathway features of fermented vegetables from Hainan,China[J].Frontiers in Microbiology,2018,9:399.
- [9]郭倩倩,卢彪,晴隆,等.酸菜发酵过程中微生物菌群多样性动态分析[J].中国酿造,2020,39(8):86-91.
- [10]张颖,孙慧君,姜静,等.酸菜中细菌群落结构多样性分析[J].食品科技,2017,42(1):34-39.
- [11]王昌毅,楼骏,严康,等.基于整合高通量绝对定量法的土壤微生物多样性分析[J].土壤学报,2022,59(5):1432-1446.
- [12]LOU J,YANG L,WANG H,et al.Assessing soil bacterial community and dynamics by integrated high-throughput absolute abundance quantification[J].Peer J,2018,6:4514.
- [13]PROPS R,KERCKHOF F M,RUBBENS P,et al.Absolute quantification of microbial taxon abundances[J].The ISME Journal,2017,11(2):584-587.
- [14]国家质量监督检验检疫总局.食品中总酸的测定:GB/T 12456-2008[S].北京:中国标准出版社,2008.
- [15]国家卫生和计划生育委员会,国家食品药品监督管理总局.食品安全国家标准食品中亚硝酸盐与硝酸盐的测定:GB 5009.33-2016[S].北京:中国标准出版社,2016.
- [16]国家卫生和计划生育委员会,国家食品药品监督管理总局.食品安全国家标准食品微生物学检验菌落总数测定:GB 4789.2-2016[S].北京:中国标准出版社,2016.
- [17]李凤姿,张媛,王小垒,等.乳酸杆菌对东北酸菜发酵特性的影响解析[J].食品与生物技术学报,2020,39(5):104-111.
- [18]ZHANG Z,QU Y,LI S,et al.Soil bacterial quantification approaches coupling with relative abundances reflecting the changes of taxa[J].Scientific Reports,2017,7(1):4837.
- [19]张庆芳,迟乃玉,郑燕,等.乳酸菌降解亚硝酸盐机理的研究[J].食品与发酵工业,2002(8):27-31.
- [20]姚荷,谭兴和,张春艳,等.发酵蔬菜中乳酸菌降解亚硝酸盐的研究进展[J].中国酿造,2018,37(7):22-25.
- [21]郑雪婷.氨基酸的有关知识[J].科技信息,2014(15):236,297.
- [22]唐阔,王卫,吉莉莉,等.乳酸菌降解亚硝酸盐和反硝化细菌亚硝酸盐还原酶结构研究进展[J].中国调味品,2020,45(4):38-43.