DGGE法分析酱菜中酵母菌多样性Analysis of Yeast Diversity in Pickles by DGGE
燕平梅,魏爱丽,陈燕飞,赵文婧
摘要(Abstract)：
为了探究酱菜中酵母菌的多样性,以两种市售酱菜为研究对象,从酱菜汁中提取微生物基因组DNA。对26SrDNA基因片段进行扩增。经变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术分离混合酵母菌26SrDNA的基因条带。回收DGGE电泳中荧光度强的电泳带,经克隆后测定碱基序列,与GenBank库序列对比鉴定,并构建系统发育树。使用Quantity One软件分析DGGE凝胶图谱,分析酱菜中酵母菌的多样性。结果表明,袋装酱菜(用JA编号)样品与散装酱菜(用JB编号)样品的均匀度指数无显著差异(P>0.05)。JA样品的多样性指数和丰富度指数显著大于JB样品(P<0.05),表明JA样品的酵母菌种类较丰富。酱菜样品中的3条优势条带分别与Pichia fermentans(乳源酵母)、Candida tropicalis(热带假丝酵母)、Candida tropicalis(热带假丝酵母)的菌株相似,相似度分别为88%、98%、98%。两种酱菜样品的共有菌是Candida tropicalis(热带假丝酵母)。袋装酱菜样品的特有菌是乳源酵母(Pichia fermentans),散装酱菜样品没有特有菌种。
关键词(KeyWords)： 酱菜;酵母菌;聚合酶链式反应(PCR);变性梯度凝胶电泳(DGGE)
基金项目(Foundation): 国家自然基金项目(31171743);; 山西省重点研发项目(201603D221008-1)
作者(Author): 燕平梅,魏爱丽,陈燕飞,赵文婧
参考文献(References)：
- [1]赵子彤,吴澎单,单长松,等.山东酱腌菜发展现状及对策分析[J].中国调味品,2017,42(5):167-170.
- [2]傅亮,鲍玲玲,吴炳鸿,等.豆类多肽对酱菜发酵中亚硝酸盐降解影响的研究[J].中国调味品,2012,37(11):32-35.
- [3]李利军,卢美欢,关安生,等.陕西酱腌菜生产技术现状及发展对策研究[J].中国调味品,2009,34(11):43-46.
- [4]荆雪娇,李艳琴,燕平梅,等.传统发酵蔬菜微生物群落结构分析[J].食品与发酵科技,2016(1):28-32.
- [5]燕平梅,荆雪娇,李艳琴,等.9种蔬菜发酵体系真核微生物群落结构的分析[J].食品工业科技,2016,37(22):186-189.
- [6]聂志强,王敏,郑宇.3种分子生物学技术在传统发酵食品微生物多样性研究中的应用[J].食品科学,2012(23):346-350.
- [7]赵兴青,杨柳燕,陈灿,等.PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究[J].生态学报,2006,26(11):3610-3616.
- [8]Muyzer G,Wall D E.Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain reaction-amplified genes coding for16SrRNA[J].Applied and Environmentel Microbiology,1993,59(3):695-700.
- [9]赵柏霞,闫建芳,刘秋,等.黄瓜根际土壤细菌群落的16SrDNAPCR-DGGE分析[J].中国蔬菜,2015(12):33-37.
- [10]尹立明,李旭,魏莹,等.浅谈我国酱腌菜的生产现状及发展[J].中国调味品,2012,37(9):16-18.
- [11]张先琴,张小平,敖晓琳,等.PCR-DGGE分析四川地区家庭制作泡菜中微生物多样性[J].食品科学,2013,34(12):129-134.
- [12]Cocolin L,Aggio D,Manzano M,et al.An application of PCR-DGGE analysis to profile the yeast populations in raw milk[J].International Dairy Journal,2002,12(5):407-411.
- [13]高秀芝,王小芬,刘慧,等.PCR-DGGE分析天源酱园豆酱发酵过程中微生物多样性[J].食品科学,2011(1):112-114.
- [14]乌日娜,于美玲,孟令帅,等.PCR-DGGE分析东北自然发酵酸菜中的微生物多样性[J].现代食品科技,2014(10):8-12.
- [15]燕平梅,张小冰,柴政,等.基于DGGE方法分析低氯化钠浓度对发酵白菜原核微生物群落结构的影响[J].食品工业科技,2017,38(11):144-151.
- [16]Chang H W,Kim K H,Nam Y D,et al.Analysis of yeast and archaeal population dynamics in kimchi using denaturing gradient gel electrophoresis[J].International Journal of Food Microbiology,2008(7):1261-1269.
- [17]付琳琳,曹郁生,李海星,等.应用PCR-DGGE技术分析泡菜中乳酸菌的多样性[J].食品与发酵工业,2005(12):103-105.